сто-ло-на-ча́ль-ник

Существительное, одушевлённое, мужской род, 2-е склонение (тип склонения 3a по классификации А. А. Зализняка).

Производное: стол, начальник ➔ стол + о + начальник + ∅ (чистое сложение; интерфиксация с |о|) [Тихонов, 2003].

Корень: -стол-; интерфикс: -о-; корень: -началь-; суффикс: -ник [Тихонов, 1996].

Происходит от стол + начальник;

• первая часть — из праслав. *stolъ, от кот. в числе прочего произошли: др.-русск. столъ «стол; престол; сидение», ст.-слав. столъ (др.-греч. σκαμνίον, θρόνος), укр. стіл (род. п. стілá), болг. стол «стул; трон; кресло», сербохорв. сто̑ (род. п. сто̀ла) «стул; кресло; стол», словенск. stòl (род. п. stólа) «стул; кресло; стол; кровельные стропила», чешск. stůl (род. п. stolu) «стол», словацк. stol «стол», польск. stół (род. п. stołu) «стол», в.-луж. stoł, н.-луж. stoł «стул; стол; престол». Сравнивают с лит. stãlas «стол», др.-прусск. stalis (вин. п. stallan), лит. ùžstalis м. «место за столом», лит. pastõlai мн. «помост», др.-прусск. stallit «стоять», готск. stōls м. «стул», др.-сканд. borþstóll «станина стола», далее сюда же *stati, *stojǫ «стоять». С др. стороны, напрашивается толкование из формы, связанной чередованием гласных со steljǫ, stьlati (см. стелить), а также сравнение с санскр. sthálam ср. р., санскр. sthalī ж. «возвышение; холм; материк». Использованы данные словаря М. Фасмера. См. Список литературы.;
• вторая часть — из существительного начало и глагола начать, далее от праслав. *načęti, от кот. в числе прочего произошли: др.-русск. начати, начьну, ст.-слав. начѧти, начьнѫ (греч. ἄρχομαι), зачѧти, зачьнѫ (προάγειν), русск. начать, почать, болг. начна «начну», сербохорв. на̏чне̑м, на̀че̑ти «надрезать (хлеб)», словенск. načéti, načnèm, в.-луж. nаčеć, načnu, н.-луж. nасеś, nacnu.

• столоначальник // Научно-информационный «Орфографический академический ресурс „Академос“» Института русского языка им. В. В. Виноградова РАН. orfo.ruslang.ru
• Зализняк А. А. столоначальник // Грамматический словарь русского языка. — Изд. 5-е, испр. — М. : АСТ Пресс, 2008.
• Тихонов А. Н. Словообразовательный словарь русского языка: В 2 т. — 3-е изд., испр. и доп. — М. : АСТ : Астрель, 2003.